Nach einer Ausbildung zum Hochbauzeichner studierte Ernst Spycher Architektur an der Kunstakademie Düsseldorf. Seit 1989 ist er in Basel als selbstständiger Architekt tätig. 2000/01 hatte er eine Gastprofessur am Lehrstuhl Entwerfen und Gebäudelehre II an der Bauhaus-Universität in Weimar inne, wo er 2017 promoviert wurde.