Jacques Heers nació en París, y fue alumno en La Ferté-Bernand en el departamento de Sarthe, donde sus padres tenían un comercio. Tras su paso por el instituto, acude a estudiar Historia en La Sorbona. Tras licenciarse fue profesor en diferentes centros franceses, como en Alençon o Le Mans. Desde 1951 se vinculó al Centre National de la Recherche Scientifique. Allí fue alumno de Braudel, que le envió a Italia para preparar una tesis doctoral sobre Génova en el siglo xv, la cual fue terminada en 1958. A su regreso a Francia, fue asistente de Georges Duby en la Universidad de Aix-en-Provence. Un año antes había sido nombrado profesor en la Universidad de Argel, donde ejercería hasta 1962. A partir de ahí fue profesor en diferentes universidades, desde la de Caen hasta La Sorbona.